2018年11月21日下午3点,北京大学前沿交叉系列沙龙之“蛋白质设计”在静园一院201会议室成功举办。本次沙龙由化学学院的邹鹏研究员组织发起并主持,邹老师结合了2018年诺贝尔化学奖授予定向分子进化领域为背景,邀请了北京大学化学学院的来鲁华教授、王初研究员、张文彬研究员、医学部药学院的刘涛研究员、定量生物中心的宋晨研究员以及生命科学学院的井淼博士作报告。来自北京大学、清华大学、北大医学部位多位生命科学领域专家以及相关公司和协会,如北京加科思新药研发有限公司,人体健康科技促进会,乃至投资领域的PCJ基金、仙瞳资本、晶泰科技等公司也参与了本次沙龙。
沙龙伊始,北京大学前沿交叉学科研究院成果转化办公室的傅晓燕老师,向大家介绍了前沿交叉学院历史与发展背景,以及组织和举办前沿交叉学科系列沙龙的初衷与目标,希望大家畅所欲言,深入交流,在科研与成果应用和转化之间碰撞出更多的火花。
本次沙龙的主题为“蛋白质设计”。王初研究员首先带来了“计算机辅助的功能蛋白质设计”报告,王老师结合自己之前的工作成果,从蛋白质结构设计目的、需要满足的条件、常规使用的方法手段及蛋白设计的潜在价值等方面做了深入浅出地讲解。随后和与会嘉宾就“计算机功能辅助设计得到的蛋白活性低,该如何解决”、“有多少结果能够进行转化,是否有实际转化产品”等问题进行了探讨。
随后来鲁华教授为大家带来了“计算机蛋白设计”的主题报告,结合领域内的研究焦点及相关问题向大家介绍了自己的研究方法与成果,并对王初研究员的报告进行了补充,她表示计算设计只是一个起点,需要探索结构功能之间的关系。
接着,来自北大医学部药学院的刘涛研究员带来了“基因密码子技术在制药领域的应用”报告。刘老师结合蛋白质药物的背景与发展,介绍了分泌蛋白的文库构建与单细胞筛选和基因密码子扩展技术,并着重介绍了基因密码子扩展技术在医药领域的应用前景与目前遇到的问题。他认为,基因密码子扩展技术,在抗体药物偶联、灭活疫苗开发以及基因编辑等领域都有着广泛的应用前景。随后,刘涛研究员和与会嘉宾讨论了大家共同关注的“密码子扩展技术在CAR-T方面的应用价值”等问题。
随后张文彬研究员带来了“蛋白质拓扑结构研究”的报告,他从非线性蛋白质的背景引入了蛋白拓扑结构工程的研究内容,对拓扑结构工程的原理方法、突出优势及应用前景等诸多方面进行了阐述。针对与会嘉宾比较关注的应用领域的内容,张老师以蛋白拓扑结构在药物冻干领域为例进行了介绍,同时在讨论中,他还提出目前这一研究存在的问题是还做不了结构比较大的蛋白质,只能用酶切等手段观测结构。
之后来自定量生物学中心的宋晨研究员,带来了“计算机预测蛋白结构、功能、活性”的报告。宋老师着重以CASP竞赛为例,介绍了通过计算模拟设计蛋白,即以动力学模拟进行设计,然后再用传统质谱手段进行验证。他结合ALPHA FOLD得到的突出成绩,分析了人工智能在蛋白质设计方面的价值,并对计算模拟设计的应用方面同与会嘉宾做了更为深入的讨论。
最后,来自生命科学学院的井淼博士为大家做了“荧光探针的应用”的报告。井博士结合自己在李毓龙研究员课题组的研究方向,向大家介绍了神经递质荧光探针的原理及实验方法,分享了其开发过程和结果,并对技术的应用前景进行了相关探究和展望。他指出了在研发药物方面,此技术在寻找有效成分方面所具备的优势:低成本、速度快和高通量。
作为沙龙尾声,邹鹏研究员对本次沙龙的讨论进行了总结,并邀请与会的工业领域、投资领域专家谈了自身的收获及看法。各位与会嘉宾围绕着蛋白质设计的发展的应用前景进行了热烈交流。本次沙龙再次为科研工作者与应用领域专家提供了一个前瞻而开放的交流平台,为交叉学科的发展做出了独特的贡献。